1、药流的过程中会引起腹痛恶心、腹泻等不良反映药流服药后会有胃肠道反应，表现为恶心、呕吐、腹泻及由于子宫收缩可产生下腹痛，个别人有发热、头晕、皮肤潮红及发麻等症状。另外，药流服药后约有25%的女性，会有流产失败或者流产不全的情况，这样就必须进行清宫术。此外，药流时虽已排出绒毛胎囊，但子宫内的蜕膜组织则是慢慢排出的，故出血时间较长，平均18-20日。部分妇女会因出血多、时间长而导致贫血或并发子宫内膜炎、盆腔炎等。

　　2、药流易感染通常，药流后，阴道出血时间较长。少则十几天，多则几个月，在这过程中，抵抗力弱，细菌繁殖能力强，整个生殖道极易感染，造成阴道炎、宫颈炎、盆腔炎、附件炎等各种疾病。

　　3、药流成功率低自近几年来，很多因药流不清，到医院做清宫手术而导致不孕，引起妇科炎症的例子比比皆是。应用于药流的米非司酮诞生才短短十几年的时间，临床试验还不够充分。成功率仅为75%。若发现药流不清，需立即到医院做清宫手术。不然残余的胎膜组织会造成血崩，甚至会有生命危险。

　　4、药流会打乱女性内分泌除了对肉体上的损伤外，其引起的激素变化对人体的伤害也是难以察觉的。米非司酮具有甾体结构，是一种抗孕激素，从子宫受体水平干扰孕酮对妊娠的支持作用。它打乱了内分泌，而机体需要时间来恢复的。

　　5、药流易造成不孕药流易导致输卵管堵塞，宫颈粘连，造成不孕;药流不干净，清宫手术不当，也有可能造成不孕;药流对子宫和卵巢的伤害过大，因此也是造成不孕的原因之一。